Le fonds s’organise autour de données primaires issues des fouilles archéologiques sur 8 sites terrestres (relevés, minutes). Il est également composé de données secondaires liées au travail de recherche et de publication (plans encrés).

La Madrague de Giens est une fouille sous-marine emblématique du Centre Camille Jullian. L'épave est découverte en 1967, mais les campagnes de fouilles débutent en 1972 et s'étalent jusqu'en 1982, sous la co-direction d'André Tchernia et Patrice Pomey. Cette fouille a affirmé les techniques d'archéologie sous-marine.
Ces archives retracent l'histoire de la fouille, scientifiquement et administrativement, depuis la découverte et la prospection, jusqu'aux projets et études réalisées après l'arrêt des campagnes de fouille. Elles sont une source d'informations concernant le déroulement administratif de la fouille ainsi que les nécessités financières et matérielles. Ce sous-fonds retrace également le déroulement scientifique des campagnes de fouille et l'étude de la cargaison de l'épave. Une grande partie des documents relatent la portée de la fouille en terme de valorisation, avec les différents projets de musées ainsi que les colloques internationaux et les publications.
Ce sous-fonds représente une source historiographique et scientifique particulièrement complète sur toutes les campagnes de fouilles et les études qui en découlent.

Ces documents relatent la découverte de l'épave et la prospection. Les documents administratifs sont une source d'informations sur les moyens matériels de découverte de l'épave et la collaboration avec l'Ecole de Plongée de la Marine Nationale. Les documents scientifiques exposent les techniques de prospection ainsi que le mobilier découvert.

-Marchés avec les fournisseurs de matériel marin : catalogue, plan

-Concours de la Marine Nationale : correspondance avec le Ministère des Affaires Culturelles et l’Ecole de Plongée de la Marine Nationale

• Prospection et découverte de l’épave: plan de repérage topographique, relevés topographiques, photographies

Documentation produite par Philippe Leveau lors de la reprise de la fouille en 1967-1968. En 1961, la fouille avait été placée sous la direction d'E. Stawski, collaborateur du Service des Antiquités, sous le contrôle de J. Lassus, directeur du Service.

• Formation en plongée: circulaire